Datadoktorn Zelminas forskning syftar till att öka förståelsen av sjukdomar

- Avsikten med min forskning är i första hand att hitta meningsfulla tillämpningar av metoder för att bättre förstå sjukdomar på molekylär nivå, t ex cancer. Det handlar om att hitta vilka processer som är gemensamma för olika cancertyper och vilka som är cancerspecifika.

Zelmina Lubovac är nybliven doktor i systembiologi. Hon forskar vid Högskolan i Skövde och lade tidigare i år fram sin avhandling vid Heriot-Watt-universitetet i Edinburgh, Skottland.

Att studera molekylära nätverk snarare än enskilda molekyler för att förstå komplexa biologiska mekanismer är en vanlig systembiologisk ansats. Syftet med detta kan vara att uppnå ökad förståelse för sjukdomsmekanismer.

- De data som används i mina studier kommer från storskaliga tekniker för identifiering av fysiska interaktioner mellan proteiner i jäst, bland annat en teknik som kallas för "yeast two-hybrid system". Förhoppningen är att de rön jag får fram ska leda till ökad förståelse av sjukdomar på molekylär nivå. På längre sikt kan de kanske kunna omsättas i praktisk nytta vid utveckling av prognosmetoder och behandlingar, t ex av cancersjukdomar.

Kombinerar olika information

Zelmina Lubovac började studera dataekonomi vid Högskolan i Skövde för drygt tio år sedan. Sedan dess har hon både tagit en filosofi kandidatexamen och en magisterexamen i datavetenskap. Och nu är Zelmina Lubovac dessutom doktor i systembiologi.

 I sin avhandling, som bär namnet Identifying Functionally and Topologically Cohesive Modules in Protein Interaction Networks, presenterar Zelmina nya metoder för att identifiera så kallade moduler i proteinnätverk. Det sker genom att kombinera information om nätverkets struktur med information om de interagerande proteinernas biologiska funktion.

Djupare förståelse

Avsikten är att förutsäga funktionen av nya proteiner, att identifiera dessa så kallade moduler. En modul är en organisatorisk enhet i ett nätverk som består av proteiner som interagerar med varandra i en tätt sammanhållen struktur för att uppnå en viss funktion.

 - Med andra ord handlar det om att analysera grupper av proteiner för att se hur de samverkar, att generera nya hypoteser om proteinernas inblandning i biologiska processer baserat på den kunskap som man har om modulen, berättar Zelmina Lubovac..

 Resultaten av Zelminas forskning kan leda till en djupare förståelse av strukturer i proteinnätverk och av hur proteinerna i våra celler samarbetar i moduler.

 - Genom att tillämpa de utvecklade metoderna kan vi i framtiden identifiera moduler som kan kopplas till sjukdomar. Detta kan i sin tur leda till ökad förståelse av sjukdomar och omsättas i praktisk nytta vid utveckling av prognosmetoder och behandlingar.

För mer information. Kontakta Zelmina Lubovac, tfn 0500-448305,

e-post: zelmina.lubovac@his.se