Flongle blir verktyg inom sepsisforskning

Sedan några månader tillbaka finns nu Flongle på Högskolan i Skövde, en mini-sekvenseringsenhet som mäter DNA och RNA i realtid. Det här är en unik liten manick. Den släpptes 2019 av Oxford Nanopre Technologies och anses vara den senaste analysenheten i världen. Den lilla enheten ansluts till en befintlig MinION, en enhet som Högskolan investerade i för några år sedan.

- Realtidsfunktionen fungerar så att den jämför sekvenseringsresultat med klassificeringsdatabaser direkt. Det innebär att väntetiden kan minskas från flera dagar till bara några timmar, säger John Baxter, adjunkt i biovetenskap vid Högskolan i Skövde.

Högskolan kommer nyttja den lilla och kostnadseffektiva Flonglen flitigt som både forsknings- och undervisningsverktyg.
- Vi breddar våra studenters karriäralternativ och säkerställer att de är uppdaterade inom den senaste sekvenseringstekniken. Ett vetenskapligt område som utvecklas snabbt, menar John Baxter.

Stor betydelse för Högskolans Sepsis-forskning

- Flonglen kommer också att spela en stor roll i vår Sepsis-forskning. Vi forskar på möjligheten att korta provsvarstiden. Sepsis, också kallad blodförgiftning, är en sjukdom som inom loppet av några timmar kan resultera i döden om den inte behandlas på lämpligt sätt. Därför är det viktigt att snabbt få fram ett provsvar, säger John Baxter.

Nanopore-enheter som Flongle kan upptäcka förekomsten av bakteriearter och antibiotikaresistens på under 4 timmar. En snabb identifiering av mikroorganismer i blodet och deras potentiella antimikrobiella resistens skulle alltså kunna resultera i en snabb och effektiv antibiotikabehandling. För någon som blivit diagnostiserad med sepsis kan det innebära skillnaden mellan liv och död.

- Än finns dock en del arbete kvar för att säkerställa resultatens tillförlitlighet innan den kan skalas upp och användas som diagnosverktyg på exempelvis sjukhus, men vi jobbar på det, avslutar John Baxter. 

Kontakt

John Baxter, adjunkt i biovetenskap
john.baxter@his.se, 0500-448665