Tillförlitlig information tack vare digital bildanalys

Digital bildanalys möjliggör snabba, användaroberoende och reproducerbara metoder för att införskaffa information om situationer och tillstånd som går att avbilda. I en doktorsavhandling från SLU i Uppsala redogörs för metoder för att identifiera och beskriva speciella strukturer i 2D- och 3D-mikroskopibilder. Metoderna är framtagna och utvecklade för specifika tillämpningar. En metod identifierar enskilda porer eller hålrum i 3D-elektronmikroskopibilder av papper. Hur enskilda porers utseende och fördelning påverkar kvaliteten på papperet kan sedan studeras. En annan metod identifierar och beskriver olika varianter av ett virus i 2D-elektronmikroskopibilder av infekterade celler. Metoden ar tänkt att användas för att övervaka och kartlägga infektionscykeln av viruset, samt för att beskriva hur ett läkemedel påverkar de olika virusvarianterna. En tredje identifieringsmetod hittar enskilda cellkärnor i fluoroscencemikroskopibiler av vävnad. En bra och stabil sådan metod behövs för att kunna analysera vävnadsstruktur och mängder av markerade substanser i cellkärnorna. Sådana analyser används vid studier av flera olika sjukdomar. Det sista tillämpningsområdet är analys av 3D-elektronmikroskopibilder av proteinlösningar. En identifieringsmetod minskar mängden visuellt arbete som krävs för att hitta de proteiner som man vill studera. Två sätt att förenklat beskriva proteinmolekyler finns också med i avhandlingen. Dessa representationer kan användas för att analysera hur flexibelt ett protein är och hur det kan binda till andra molekyler, vilket är viktig information vid läkemedelsframtagning. Fredagen den 1 april kl 10.15 försvarar civilingenjör Ida-Maria Sintorn, Centrum för bildanalys, SLU i Uppsala, sin avhandling med titeln Segmentation Methods and Shape Descriptions in Digital Images. Applications in 2D and 3D Microscopy. Opponent är professor Max Viergever, Image Sciences Institute, University Medical Center Ütrecht, Nederländerna. Lokal: Häggsalen, Ångströmslaboratoriet, Uppsala. Mer information: Ida-Maria Sintorn, Centrum för bildanalys, SLU i Uppsala, tel 018-471 34 71. E-post: Ida-Maria.Sintorn@cb.slu.se