Ny metod tillåter genetisk analys av enskilda celler

Nu har Uppsalaforskare utvecklat en molekylär metod som klarar av att positionsbestämma och samtidigt urskilja genetisk variation i enskilda DNA-molekyler. Metoden innebär ett signifikant framsteg för mikroskop-baserade DNA-analysmetoder och kan förväntas möjliggöra nya typer av analyser inom forskning och diagnostik. Det blir allt viktigare att kunna studera förekomsten och lokaliseringen av genfragment i enskilda celler för att kunna förstå biologiska processer och fastställa utbredningen av t ex tumörceller i vävnadsprover. De metoder som hittills har funnits tillgängliga för att studera genfragments utbredning i cellpreparat klarar inte av att urskilja genetisk variation bland fragmenten. Denna variation manifesterar sig oftast som skillnader i enstaka baspar, vilka är de minsta byggstenarna i gener. I forskargruppen för molekylär medicin på Rudbecklaboratoriet, ledd av Professor Ulf Landegren, har nu docent Mats Nilsson och doktoranden Chatarina Larsson utvecklat en metod som för första gången förmår urskilja genetisk variation i enskilda DNA molekyler i cellpreparat och vävnadsprover som fästs på ett mikroskopglas. Metoden, som publiceras i decembernumret av den vetenskapliga tidskriften Nature Methods, har tagits fram i samarbete med forskare i Danmark och Holland. Metoden har använts för att studera förekomsten av en punktmutation i en mitokondriell gen i mänskliga celler och vävnadssnitt. Mitokondrien är den del av våra celler som står för cellens energiomsättning. Defekter i mitokondriens gener har visat sig kunna orsaka svåra neurologiska sjukdomar, men de kan också orsaka diabetes och tros kunna bidra till åldrande. Den nya metoden ger möjligheter att bättre förstå hur mutationer i mitokondriegener är spridda bland olika organ i kroppen. Förhoppningarna är att metoden ska kunna utvecklas vidare för att även kunna studera andra målmolekyler, såsom gener i cellkärnan, RNA molekyler, samt bakterier och virus som infekterat vävnader. Länk till artikeln: http://www.nature.com/cgi-taf/DynaPage.taf?file=/nmeth/journal/v1/n3/full/nmeth723.html Länk till tidskriften: http://www.nature.com/nmeth/index.html. Kontaktperson: Docent Mats Nilsson, tel: 018-471 48 16, 073-053 78 76 eller via E-mail: mats.nilsson@genpat.uu.se